水患一向是南科最令人頭痛的問題，以往幾乎是遇雨成災，「治水」是南科管理局的首要課題。這次八八水災，南科附近的鄉鎮都受到影響，也有積水問題，不過地勢較低的南科卻毫髮無傷，台南縣長蘇煥智指出，這顯示串連區內各滯洪池的康橋計畫奏效，南科已經徹底走出水患陰霾，不必擔心再有水患。早在政府遴選園區區位期間，南科就因地勢低窪，屢屢受到遴選委員質疑。認為此處低窪積水的問題，將使高科技投資泡湯。在選定此一位址之後，就展開挖掘大面積滯洪池的治水計畫。蘇煥智就任縣長後，則進一步提出「康橋計畫」，挖了多達28公頃的公滯一與公滯二滯洪池，更將區內既有的滯洪池予以串連，讓水流得以匯流互通，並配合進行綠帶規劃，將防洪設施轉化為水景。蘇煥智指出：「這次八八水災，以往南科周邊沒淹水的鄉鎮都淹了。往年曾淹水的南科，卻完全沒有積水的問題。」他表示，南科周邊鄉鎮淹水的原因在於，曾文水庫管理局不當洩洪，造成鄰近的鄉鎮如善化等地淹水，導致居民嚴重損失，對此他一定會對中央水利署提出國賠的要求。
#@1@#而地勢較低的南科卻沒有淹水，主要是滯洪池串連後發揮效果，讓洪水可以快速宣洩。蘇煥智信心十足地表示：「經過這次百年一見的洪水洗禮，證明南科已經擺脫淹水的問題，徹底跟水患說bye bye」。蘇煥智的康橋計畫包括為南科增建5座滯洪池。其中「公滯十」面積約有4公頃，曾為台灣燈會的主場地，「公滯四」位於最南邊，面積約有5.2公頃，「公滯十一」，總面積11公頃，而「公滯一」和「公滯二」的規模最大，總面積達40公頃。未來則打算在南科與樹谷園區南邊再開挖一處蓄水池台南大湖，旱季儲水，雨季蓄洪。目前康橋計畫的滯洪池水道串連工程已經完成，景觀工程也已經開始，整合水道與綠帶，規劃了所謂「康橋十景」。日後南科不僅沒有水患問題，更實現如詩人徐志摩的「再別康橋」所描繪的英國劍橋(Cambridge)般美麗的生態與水岸景觀，為台南人再增添一處休閒的景點。
